Det er mange etniske grupper i landet. Forenklet kan de deles inn i tre; ”Østlendinger” av indo-mongolsk opprinnelse,”Vestlendinger” av tibetansk opphav, og ”Sørlendinger” av nepalsk opphav. Mye av det som omtales som bhutanske skikker og tradisjoner, tilhører egentlig den etniske gruppen Ngalogene, ”Vestlendingene”.
Lotshampaene, ”Sørlendingene”, er i hovedsak hinduer. Denne gruppen har vært i sentrum for en politisk svært betent sak siden slutten av 80-tallet. Mange Lotshampaer ble betegnet som ulovlige innvandrere, ble fratatt sine statsborgerskap og måtte forlate landet.